Die Leitungsgremien (Organe) des Vereins sind neben der Mitgliederversammlung der Vorstand, das Präsidium und die Geschäftsführung.
Dem Vorstand obliegt die strategische Gesamtverantwortung für die Ausrichtung der Arbeit der BAG W. In diesem Sinne beschließt er u.a. Einzelheiten des Arbeitsprogramms unter besonderer Berücksichtigung entsprechender Anregungen des Hauptausschusses und der Beschlüsse der Mitgliederversammlung. Das Präsidium vertritt den Verband zwischen den Vorstandssitzungen im Rahmen der Beschlüsse der Mitgliederversammlung und des Vorstands. Die Geschäftsführung führt die Geschäfte des Vereins gemäß der Satzung, der Geschäftsordnung des Vorstands und den Beschlüssen der Vereinsorgane.